Важной задачей проекта стало сохранение и воссоздание исторического облика памятника архитектуры. В рамках проекта благоустройства территории монастыря были проведены работы по дендрологическому обследованию территории. Целью работ являлась оценка состояния зелёных насаждений и жизнеспособности деревьев на монастырской территории площадью 15,81га. Была разработана проктная документация по воссозданию исторического облика ансамбля Новоиерусалимского монастыря. Большое внимание уделили не только пространству внутри монастырского комплекса, но и прилегающей территории. Склон близ монастыря был разбит на сектора. По каждому из них собиралась историческая справка, и решения по посадке деревьев и размещению объектов благоустройства принимались экспертной группой, состоящей из историков и реставраторов.